Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DMDP11532 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DMDP11532 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DMDP11532 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DMDP11532 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DMDP11532 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DMDP11532 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DMDP11532 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DMDP11532 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DMDP11532 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DMDP11532 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DMDP11532 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DMDP11532 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DMDP11532 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DMDP11532 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DMDP11532 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DMDP11532 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DMDP11532 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DMDP11532 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DMDP11532 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DMDP11532 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DMDP11532 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DMDP11532 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DMDP11532 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DMDP11532 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DMDP11532 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DMDP11532 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DMDP11532 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DMDP11532 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DMDP11532 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DMDP11532 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DMDP11532 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DMDP11532 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DMDP11532 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DMDP11532 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DMDP11532 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DMDP11532 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DMDP11532 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DMDP11532 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DMDP11532 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DMDP11532 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DMDP11532 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DMDP11532 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DMDP11532 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DMDP11532 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DMDP11532 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DMDP11532 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DMDP11532 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DMDP11532 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DMDP11532 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DMDP11532 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DMDP11532 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DMDP11532 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DMDP11532 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DMDP11532 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DMDP11532 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DMDP11532 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DMDP11532 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DMDP11532 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DMDP11532 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DMDP11532 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DMDP11532 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DMDP11532 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DMDP11532 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DMDP11532 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DMDP11532 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DMDP11532 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DMDP11532 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DMDP11532 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DMDP11532 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DMDP11532 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DMDP11532 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DMDP11532 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DMDP11532 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DMDP11532 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DMDP11532 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DMDP11532 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DMDP11532 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DMDP11532 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DMDP11532 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DMDP11532 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DMDP11532 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DMDP11532 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DMDP11532 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DMDP11532 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DMDP11532 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DMDP11532 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DMDP11532 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DMDP11532 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DMDP11532 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DMDP11532 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DMDP11532 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DMDP11532 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DMDP11532 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DMDP11532 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DMDP11532 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DMDP11532 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DMDP11532 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DMDP11532 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DMDP11532 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms