Protein–RNA interactions for Protein: P06753

TPM3, Tropomyosin alpha-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3P06753 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPM3P06753 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPM3P06753 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPM3P06753 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPM3P06753 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TPM3P06753 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPM3P06753 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPM3P06753 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPM3P06753 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPM3P06753 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPM3P06753 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPM3P06753 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPM3P06753 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPM3P06753 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPM3P06753 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPM3P06753 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPM3P06753 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TPM3P06753 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPM3P06753 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPM3P06753 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPM3P06753 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPM3P06753 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPM3P06753 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPM3P06753 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPM3P06753 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPM3P06753 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPM3P06753 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPM3P06753 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPM3P06753 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPM3P06753 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPM3P06753 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPM3P06753 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPM3P06753 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPM3P06753 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TPM3P06753 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TPM3P06753 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TPM3P06753 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPM3P06753 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPM3P06753 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPM3P06753 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPM3P06753 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPM3P06753 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPM3P06753 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPM3P06753 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPM3P06753 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPM3P06753 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPM3P06753 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPM3P06753 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPM3P06753 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPM3P06753 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPM3P06753 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPM3P06753 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPM3P06753 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPM3P06753 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPM3P06753 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPM3P06753 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPM3P06753 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPM3P06753 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPM3P06753 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPM3P06753 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPM3P06753 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPM3P06753 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPM3P06753 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPM3P06753 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPM3P06753 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPM3P06753 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPM3P06753 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPM3P06753 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPM3P06753 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPM3P06753 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPM3P06753 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPM3P06753 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TPM3P06753 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPM3P06753 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPM3P06753 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPM3P06753 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPM3P06753 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPM3P06753 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPM3P06753 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPM3P06753 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPM3P06753 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPM3P06753 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPM3P06753 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPM3P06753 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPM3P06753 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPM3P06753 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPM3P06753 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPM3P06753 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPM3P06753 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPM3P06753 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPM3P06753 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPM3P06753 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TPM3P06753 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPM3P06753 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPM3P06753 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPM3P06753 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPM3P06753 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPM3P06753 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPM3P06753 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPM3P06753 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms