Protein–RNA interactions for Protein: P04155

TFF1, Trefoil factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF1P04155 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFF1P04155 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFF1P04155 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFF1P04155 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TFF1P04155 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TFF1P04155 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TFF1P04155 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFF1P04155 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFF1P04155 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFF1P04155 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFF1P04155 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFF1P04155 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFF1P04155 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFF1P04155 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFF1P04155 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFF1P04155 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFF1P04155 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TFF1P04155 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TFF1P04155 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TFF1P04155 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFF1P04155 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFF1P04155 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFF1P04155 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFF1P04155 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFF1P04155 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFF1P04155 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFF1P04155 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFF1P04155 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TFF1P04155 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFF1P04155 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFF1P04155 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFF1P04155 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFF1P04155 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFF1P04155 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFF1P04155 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFF1P04155 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFF1P04155 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFF1P04155 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFF1P04155 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFF1P04155 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFF1P04155 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFF1P04155 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFF1P04155 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFF1P04155 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFF1P04155 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFF1P04155 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFF1P04155 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFF1P04155 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFF1P04155 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TFF1P04155 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFF1P04155 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFF1P04155 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TFF1P04155 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFF1P04155 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TFF1P04155 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TFF1P04155 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFF1P04155 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFF1P04155 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFF1P04155 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFF1P04155 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFF1P04155 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFF1P04155 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFF1P04155 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFF1P04155 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFF1P04155 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFF1P04155 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFF1P04155 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFF1P04155 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFF1P04155 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFF1P04155 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TFF1P04155 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFF1P04155 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFF1P04155 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFF1P04155 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFF1P04155 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFF1P04155 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFF1P04155 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFF1P04155 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFF1P04155 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFF1P04155 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFF1P04155 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFF1P04155 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFF1P04155 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFF1P04155 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFF1P04155 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFF1P04155 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFF1P04155 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFF1P04155 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFF1P04155 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFF1P04155 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFF1P04155 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFF1P04155 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFF1P04155 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFF1P04155 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFF1P04155 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFF1P04155 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TFF1P04155 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFF1P04155 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFF1P04155 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFF1P04155 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms