Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
N4BP1O75113 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
N4BP1O75113 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms