Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC78A2IDD5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms