Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6W3

CAPN7, Calpain-7, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN7Q9Y6W3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN7Q9Y6W3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms