Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LYVE1Q9Y5Y7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms