Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPNE7Q9UBL6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CPNE7Q9UBL6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPNE7Q9UBL6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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