Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHCHD3Q9NX63 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHCHD3Q9NX63 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms