Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP9-8Q9BYQ0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP9-8Q9BYQ0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP9-8Q9BYQ0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP9-8Q9BYQ0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP9-8Q9BYQ0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP9-8Q9BYQ0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP9-8Q9BYQ0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP9-8Q9BYQ0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP9-8Q9BYQ0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP9-8Q9BYQ0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP9-8Q9BYQ0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP9-8Q9BYQ0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP9-8Q9BYQ0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP9-8Q9BYQ0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP9-8Q9BYQ0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP9-8Q9BYQ0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP9-8Q9BYQ0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP9-8Q9BYQ0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
KRTAP9-8Q9BYQ0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
KRTAP9-8Q9BYQ0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP9-8Q9BYQ0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms