Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG1

VPS25, Vacuolar protein-sorting-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS25Q9BRG1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPS25Q9BRG1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms