Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ3

TRIM43, Tripartite motif-containing protein 43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43Q96BQ3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM43Q96BQ3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms