Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRSF12Q8WXF0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms