Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms