Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYE1

CCDC13, Coiled-coil domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC13Q8IYE1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms