Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ6

PARP9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP9Q8IXQ6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP9Q8IXQ6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms