Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDP4

KLHL17, Kelch-like protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL17Q6TDP4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL17Q6TDP4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL17Q6TDP4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL17Q6TDP4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL17Q6TDP4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL17Q6TDP4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL17Q6TDP4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL17Q6TDP4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL17Q6TDP4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL17Q6TDP4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL17Q6TDP4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL17Q6TDP4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL17Q6TDP4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL17Q6TDP4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL17Q6TDP4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL17Q6TDP4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL17Q6TDP4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL17Q6TDP4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL17Q6TDP4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL17Q6TDP4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL17Q6TDP4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL17Q6TDP4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms