Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRIP3Q6Q6R5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRIP3Q6Q6R5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CRIP3Q6Q6R5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRIP3Q6Q6R5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRIP3Q6Q6R5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRIP3Q6Q6R5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRIP3Q6Q6R5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRIP3Q6Q6R5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRIP3Q6Q6R5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRIP3Q6Q6R5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRIP3Q6Q6R5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRIP3Q6Q6R5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRIP3Q6Q6R5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRIP3Q6Q6R5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRIP3Q6Q6R5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRIP3Q6Q6R5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRIP3Q6Q6R5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRIP3Q6Q6R5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRIP3Q6Q6R5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRIP3Q6Q6R5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRIP3Q6Q6R5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRIP3Q6Q6R5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRIP3Q6Q6R5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.1 ms