Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC93Q567U6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC93Q567U6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC93Q567U6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC93Q567U6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC93Q567U6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC93Q567U6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC93Q567U6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC93Q567U6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC93Q567U6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC93Q567U6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC93Q567U6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC93Q567U6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC93Q567U6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC93Q567U6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC93Q567U6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC93Q567U6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC93Q567U6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC93Q567U6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC93Q567U6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC93Q567U6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC93Q567U6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC93Q567U6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC93Q567U6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC93Q567U6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC93Q567U6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC93Q567U6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC93Q567U6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC93Q567U6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC93Q567U6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC93Q567U6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC93Q567U6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC93Q567U6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC93Q567U6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC93Q567U6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC93Q567U6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC93Q567U6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC93Q567U6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms