Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
COL24A1Q17RW2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
COL24A1Q17RW2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
COL24A1Q17RW2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
COL24A1Q17RW2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COL24A1Q17RW2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COL24A1Q17RW2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
COL24A1Q17RW2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COL24A1Q17RW2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COL24A1Q17RW2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COL24A1Q17RW2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
COL24A1Q17RW2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COL24A1Q17RW2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COL24A1Q17RW2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
COL24A1Q17RW2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
COL24A1Q17RW2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
COL24A1Q17RW2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
COL24A1Q17RW2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
COL24A1Q17RW2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
COL24A1Q17RW2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
COL24A1Q17RW2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
COL24A1Q17RW2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
COL24A1Q17RW2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
COL24A1Q17RW2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
COL24A1Q17RW2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
COL24A1Q17RW2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
COL24A1Q17RW2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
COL24A1Q17RW2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
COL24A1Q17RW2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
COL24A1Q17RW2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
COL24A1Q17RW2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
COL24A1Q17RW2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
COL24A1Q17RW2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
COL24A1Q17RW2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
COL24A1Q17RW2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
COL24A1Q17RW2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
COL24A1Q17RW2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
COL24A1Q17RW2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
COL24A1Q17RW2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
COL24A1Q17RW2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
COL24A1Q17RW2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
COL24A1Q17RW2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
COL24A1Q17RW2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
COL24A1Q17RW2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
COL24A1Q17RW2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
COL24A1Q17RW2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
COL24A1Q17RW2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
COL24A1Q17RW2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
COL24A1Q17RW2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
COL24A1Q17RW2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
COL24A1Q17RW2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
COL24A1Q17RW2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
COL24A1Q17RW2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
COL24A1Q17RW2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
COL24A1Q17RW2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
COL24A1Q17RW2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
COL24A1Q17RW2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
COL24A1Q17RW2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
COL24A1Q17RW2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
COL24A1Q17RW2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COL24A1Q17RW2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COL24A1Q17RW2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COL24A1Q17RW2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COL24A1Q17RW2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
COL24A1Q17RW2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
COL24A1Q17RW2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
COL24A1Q17RW2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COL24A1Q17RW2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
COL24A1Q17RW2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COL24A1Q17RW2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COL24A1Q17RW2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
COL24A1Q17RW2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
COL24A1Q17RW2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
COL24A1Q17RW2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COL24A1Q17RW2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COL24A1Q17RW2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms