Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTPRKQ15262 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTPRKQ15262 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTPRKQ15262 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTPRKQ15262 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPRKQ15262 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPRKQ15262 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPRKQ15262 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPRKQ15262 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPRKQ15262 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPRKQ15262 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPRKQ15262 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPRKQ15262 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPRKQ15262 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPRKQ15262 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PTPRKQ15262 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PTPRKQ15262 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PTPRKQ15262 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
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PTPRKQ15262 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PTPRKQ15262 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PTPRKQ15262 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PTPRKQ15262 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PTPRKQ15262 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PTPRKQ15262 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PTPRKQ15262 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PTPRKQ15262 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PTPRKQ15262 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PTPRKQ15262 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PTPRKQ15262 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PTPRKQ15262 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PTPRKQ15262 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PTPRKQ15262 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PTPRKQ15262 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PTPRKQ15262 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PTPRKQ15262 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PTPRKQ15262 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
PTPRKQ15262 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PTPRKQ15262 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PTPRKQ15262 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
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PTPRKQ15262 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
PTPRKQ15262 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PTPRKQ15262 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PTPRKQ15262 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
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PTPRKQ15262 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PTPRKQ15262 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PTPRKQ15262 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PTPRKQ15262 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PTPRKQ15262 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PTPRKQ15262 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PTPRKQ15262 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PTPRKQ15262 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PTPRKQ15262 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
PTPRKQ15262 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PTPRKQ15262 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PTPRKQ15262 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PTPRKQ15262 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PTPRKQ15262 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PTPRKQ15262 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PTPRKQ15262 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PTPRKQ15262 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PTPRKQ15262 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PTPRKQ15262 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PTPRKQ15262 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
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