Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL19A1Q14993 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms