Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRSF5Q13243 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRSF5Q13243 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRSF5Q13243 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRSF5Q13243 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SRSF5Q13243 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRSF5Q13243 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRSF5Q13243 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRSF5Q13243 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRSF5Q13243 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRSF5Q13243 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRSF5Q13243 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRSF5Q13243 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRSF5Q13243 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRSF5Q13243 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRSF5Q13243 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRSF5Q13243 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRSF5Q13243 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRSF5Q13243 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRSF5Q13243 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRSF5Q13243 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRSF5Q13243 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRSF5Q13243 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SRSF5Q13243 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRSF5Q13243 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRSF5Q13243 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRSF5Q13243 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRSF5Q13243 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRSF5Q13243 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRSF5Q13243 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRSF5Q13243 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRSF5Q13243 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRSF5Q13243 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRSF5Q13243 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRSF5Q13243 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRSF5Q13243 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRSF5Q13243 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRSF5Q13243 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRSF5Q13243 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRSF5Q13243 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRSF5Q13243 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRSF5Q13243 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRSF5Q13243 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SRSF5Q13243 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRSF5Q13243 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRSF5Q13243 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRSF5Q13243 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRSF5Q13243 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SRSF5Q13243 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
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