Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
TRAF3Q13114 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF3Q13114 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF3Q13114 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF3Q13114 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF3Q13114 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF3Q13114 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF3Q13114 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF3Q13114 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF3Q13114 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF3Q13114 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF3Q13114 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF3Q13114 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF3Q13114 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF3Q13114 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF3Q13114 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF3Q13114 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF3Q13114 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF3Q13114 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF3Q13114 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF3Q13114 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF3Q13114 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF3Q13114 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF3Q13114 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF3Q13114 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF3Q13114 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF3Q13114 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF3Q13114 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF3Q13114 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF3Q13114 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF3Q13114 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF3Q13114 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF3Q13114 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF3Q13114 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF3Q13114 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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