Protein–RNA interactions for Protein: Q02962

PAX2, Paired box protein Pax-2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX2Q02962 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAX2Q02962 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms