Protein–RNA interactions for Protein: Q02156

PRKCE, Protein kinase C epsilon type, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCEQ02156 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.2 ms