Protein–RNA interactions for Protein: P53999

SUB1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUB1P53999 HERC4-209ENST00000473533 3593 ntTSL 1 (best)5.06□□□□□ -1.65e-7■■■■■ 33
SUB1P53999 CUL3-207ENST00000451538 546 ntTSL 54.97□□□□□ -1.615e-7■■■■■ 33
SUB1P53999 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.655e-7■■■■■ 33
SUB1P53999 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.695e-7■■■■■ 33
SUB1P53999 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.75e-7■■■■■ 33
SUB1P53999 SCLT1-207ENST00000506233 3673 ntTSL 24.28□□□□□ -1.725e-7■■■■■ 33
SUB1P53999 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.755e-7■■■■■ 33
SUB1P53999 LYPLAL1-210ENST00000481007 642 ntTSL 23.97□□□□□ -1.775e-7■■■■■ 33
SUB1P53999 CUL3-212ENST00000497715 2400 ntTSL 23.95□□□□□ -1.785e-7■■■■■ 33
SUB1P53999 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.795e-7■■■■■ 33
SUB1P53999 RFC3-203ENST00000616236 612 ntTSL 33.88□□□□□ -1.795e-7■■■■■ 33
SUB1P53999 DDX24-204ENST00000553451 486 ntTSL 33.81□□□□□ -1.84e-13■■■■■ 33
SUB1P53999 CUL3-208ENST00000454323 688 ntTSL 33.65□□□□□ -1.835e-7■■■■■ 33
SUB1P53999 WDR61-204ENST00000558453 463 ntTSL 53.52□□□□□ -1.855e-7■■■■■ 33
SUB1P53999 SCLT1-206ENST00000503565 734 ntTSL 53.52□□□□□ -1.855e-7■■■■■ 33
SUB1P53999 LYPLAL1-207ENST00000475724 1715 ntTSL 33.5□□□□□ -1.855e-7■■■■■ 33
SUB1P53999 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.865e-7■■■■■ 33
SUB1P53999 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.865e-7■■■■■ 33
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SUB1P53999 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.885e-7■■■■■ 33
SUB1P53999 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.925e-7■■■■■ 33
SUB1P53999 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.945e-7■■■■■ 33
SUB1P53999 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.015e-7■■■■■ 33
SUB1P53999 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.025e-7■■■■■ 33
SUB1P53999 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.15e-7■■■■■ 33
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SUB1P53999 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.643e-34■■■■■ 33
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SUB1P53999 NDUFB8-207ENST00000529437 602 ntTSL 212.37□□□□□ -0.431e-11■■■■■ 32.7
SUB1P53999 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 32.6
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SUB1P53999 EIF3D-209ENST00000462641 887 ntTSL 27.89□□□□□ -1.154e-7■■■■■ 32.6
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SUB1P53999 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.217e-9■■■■■ 32.6
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SUB1P53999 ZFAND1-212ENST00000520635 882 ntTSL 52.31□□□□□ -2.042e-6■■■■■ 32.5
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SUB1P53999 SEC61G-207ENST00000480303 661 ntTSL 1 (best)6.73□□□□□ -1.332e-8■■■■■ 32.5
SUB1P53999 SEC61G-206ENST00000461536 437 ntTSL 23.56□□□□□ -1.842e-8■■■■■ 32.5
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SUB1P53999 FPGS-207ENST00000460181 2206 ntTSL 1 (best)15.92■□□□□ 0.142e-10■■■■■ 32.5
SUB1P53999 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.072e-10■■■■■ 32.5
SUB1P53999 FPGS-208ENST00000467826 829 ntTSL 514.88□□□□□ -0.032e-10■■■■■ 32.5
SUB1P53999 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.062e-10■■■■■ 32.5
SUB1P53999 SOD2-208ENST00000535459 581 ntTSL 29.22□□□□□ -0.931e-6■■■■■ 32.5
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SUB1P53999 TUBB-207ENST00000396384 2823 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.071e-9■■■■■ 32.5
SUB1P53999 TUBB-205ENST00000327892 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.111e-9■■■■■ 32.5
SUB1P53999 TUBB-208ENST00000396389 2903 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.141e-9■■■■■ 32.5
SUB1P53999 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.632e-9■■■■■ 32.4
SUB1P53999 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.652e-9■■■■■ 32.4
SUB1P53999 XRCC6-206ENST00000428575 2148 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.992e-9■■■■■ 32.4
SUB1P53999 XRCC6-204ENST00000405506 1958 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.072e-9■■■■■ 32.4
SUB1P53999 XRCC6-205ENST00000405878 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.092e-9■■■■■ 32.4
SUB1P53999 XRCC6-203ENST00000402580 2006 ntTSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.112e-9■■■■■ 32.4
SUB1P53999 RPL9-204ENST00000503040 571 ntTSL 42.55□□□□□ -22e-9■■■■■ 32.3
SUB1P53999 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.445e-7■■■■■ 32.3
SUB1P53999 EIF3M-213ENST00000533439 749 ntTSL 510.96□□□□□ -0.651e-8■■■■■ 32.3
SUB1P53999 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.021e-11■■■■■ 32.3
SUB1P53999 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.197e-7■■■■■ 32.3
SUB1P53999 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.37e-7■■■■■ 32.3
SUB1P53999 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.964e-7■■■■■ 32.3
SUB1P53999 UBE2V2-204ENST00000520809 2450 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.114e-7■■■■■ 32.3
SUB1P53999 UBE2V2-207ENST00000523111 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.424e-7■■■■■ 32.3
SUB1P53999 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.651e-9■■■■■ 32.2
SUB1P53999 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.811e-18■■■■■ 32.2
SUB1P53999 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.724e-9■■■■■ 32.2
SUB1P53999 ZFAND1-201ENST00000220669 1798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.722e-6■■■■■ 32.2
SUB1P53999 ZFAND1-221ENST00000523096 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.722e-6■■■■■ 32.2
SUB1P53999 ZFAND1-219ENST00000522520 1705 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.042e-6■■■■■ 32.2
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