Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GTF2E1P29083 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF2E1P29083 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF2E1P29083 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF2E1P29083 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF2E1P29083 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF2E1P29083 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF2E1P29083 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF2E1P29083 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF2E1P29083 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF2E1P29083 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF2E1P29083 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF2E1P29083 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF2E1P29083 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF2E1P29083 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF2E1P29083 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF2E1P29083 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF2E1P29083 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF2E1P29083 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF2E1P29083 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF2E1P29083 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF2E1P29083 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF2E1P29083 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF2E1P29083 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF2E1P29083 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF2E1P29083 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF2E1P29083 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF2E1P29083 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF2E1P29083 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF2E1P29083 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF2E1P29083 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF2E1P29083 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF2E1P29083 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms