Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERCC5P28715 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms