Protein–RNA interactions for Protein: P11940

PABPC1, Polyadenylate-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1P11940 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms