Protein–RNA interactions for Protein: O60635

TSPAN1, Tetraspanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN1O60635 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms