Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y597

KCTD3, BTB/POZ domain-containing protein KCTD3, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD3Q9Y597 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCTD3Q9Y597 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125 ms