Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms