Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2J2

EPB41L3, Band 4.1-like protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L3Q9Y2J2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPB41L3Q9Y2J2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EPB41L3Q9Y2J2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPB41L3Q9Y2J2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPB41L3Q9Y2J2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPB41L3Q9Y2J2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPB41L3Q9Y2J2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPB41L3Q9Y2J2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPB41L3Q9Y2J2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EPB41L3Q9Y2J2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPB41L3Q9Y2J2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB41L3Q9Y2J2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB41L3Q9Y2J2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB41L3Q9Y2J2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB41L3Q9Y2J2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB41L3Q9Y2J2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB41L3Q9Y2J2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPB41L3Q9Y2J2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPB41L3Q9Y2J2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EPB41L3Q9Y2J2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPB41L3Q9Y2J2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPB41L3Q9Y2J2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPB41L3Q9Y2J2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPB41L3Q9Y2J2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPB41L3Q9Y2J2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms