Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SETD1BQ9UPS6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SETD1BQ9UPS6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SETD1BQ9UPS6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SETD1BQ9UPS6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SETD1BQ9UPS6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SETD1BQ9UPS6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SETD1BQ9UPS6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SETD1BQ9UPS6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SETD1BQ9UPS6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SETD1BQ9UPS6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SETD1BQ9UPS6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SETD1BQ9UPS6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SETD1BQ9UPS6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SETD1BQ9UPS6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SETD1BQ9UPS6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SETD1BQ9UPS6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SETD1BQ9UPS6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SETD1BQ9UPS6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
SETD1BQ9UPS6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SETD1BQ9UPS6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SETD1BQ9UPS6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SETD1BQ9UPS6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SETD1BQ9UPS6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SETD1BQ9UPS6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SETD1BQ9UPS6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SETD1BQ9UPS6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SETD1BQ9UPS6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SETD1BQ9UPS6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SETD1BQ9UPS6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SETD1BQ9UPS6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
SETD1BQ9UPS6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SETD1BQ9UPS6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SETD1BQ9UPS6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SETD1BQ9UPS6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SETD1BQ9UPS6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SETD1BQ9UPS6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SETD1BQ9UPS6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SETD1BQ9UPS6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SETD1BQ9UPS6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SETD1BQ9UPS6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SETD1BQ9UPS6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SETD1BQ9UPS6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SETD1BQ9UPS6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
SETD1BQ9UPS6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SETD1BQ9UPS6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
SETD1BQ9UPS6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SETD1BQ9UPS6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SETD1BQ9UPS6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SETD1BQ9UPS6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SETD1BQ9UPS6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SETD1BQ9UPS6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SETD1BQ9UPS6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SETD1BQ9UPS6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SETD1BQ9UPS6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SETD1BQ9UPS6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SETD1BQ9UPS6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SETD1BQ9UPS6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SETD1BQ9UPS6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SETD1BQ9UPS6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SETD1BQ9UPS6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
SETD1BQ9UPS6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SETD1BQ9UPS6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SETD1BQ9UPS6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SETD1BQ9UPS6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SETD1BQ9UPS6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SETD1BQ9UPS6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SETD1BQ9UPS6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SETD1BQ9UPS6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SETD1BQ9UPS6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
SETD1BQ9UPS6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SETD1BQ9UPS6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SETD1BQ9UPS6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
SETD1BQ9UPS6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SETD1BQ9UPS6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SETD1BQ9UPS6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
SETD1BQ9UPS6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SETD1BQ9UPS6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SETD1BQ9UPS6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SETD1BQ9UPS6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SETD1BQ9UPS6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SETD1BQ9UPS6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SETD1BQ9UPS6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
SETD1BQ9UPS6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
SETD1BQ9UPS6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
SETD1BQ9UPS6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SETD1BQ9UPS6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SETD1BQ9UPS6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SETD1BQ9UPS6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SETD1BQ9UPS6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SETD1BQ9UPS6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SETD1BQ9UPS6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SETD1BQ9UPS6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SETD1BQ9UPS6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SETD1BQ9UPS6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SETD1BQ9UPS6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SETD1BQ9UPS6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SETD1BQ9UPS6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SETD1BQ9UPS6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SETD1BQ9UPS6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms