Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SCN11AQ9UI33 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
SCN11AQ9UI33 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms