Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPG2Q9UBF2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPG2Q9UBF2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms