Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
ZCCHC17Q9NP64 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms