Protein–RNA interactions for Protein: Q9C098

DCLK3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK3Q9C098 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCLK3Q9C098 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms