Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TIMM29Q9BSF4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TIMM29Q9BSF4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TIMM29Q9BSF4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TIMM29Q9BSF4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TIMM29Q9BSF4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TIMM29Q9BSF4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TIMM29Q9BSF4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TIMM29Q9BSF4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TIMM29Q9BSF4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TIMM29Q9BSF4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TIMM29Q9BSF4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TIMM29Q9BSF4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TIMM29Q9BSF4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TIMM29Q9BSF4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TIMM29Q9BSF4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TIMM29Q9BSF4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TIMM29Q9BSF4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TIMM29Q9BSF4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TIMM29Q9BSF4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TIMM29Q9BSF4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TIMM29Q9BSF4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TIMM29Q9BSF4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TIMM29Q9BSF4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TIMM29Q9BSF4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TIMM29Q9BSF4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TIMM29Q9BSF4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TIMM29Q9BSF4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TIMM29Q9BSF4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TIMM29Q9BSF4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TIMM29Q9BSF4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TIMM29Q9BSF4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TIMM29Q9BSF4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TIMM29Q9BSF4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TIMM29Q9BSF4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TIMM29Q9BSF4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TIMM29Q9BSF4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TIMM29Q9BSF4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TIMM29Q9BSF4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TIMM29Q9BSF4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TIMM29Q9BSF4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TIMM29Q9BSF4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TIMM29Q9BSF4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TIMM29Q9BSF4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TIMM29Q9BSF4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TIMM29Q9BSF4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TIMM29Q9BSF4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TIMM29Q9BSF4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TIMM29Q9BSF4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TIMM29Q9BSF4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms