Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 243.4 ms