Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ1

ERGIC2, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC2Q96RQ1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERGIC2Q96RQ1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERGIC2Q96RQ1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms