Protein–RNA interactions for Protein: Q93100

PHKB, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKBQ93100 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHKBQ93100 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHKBQ93100 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PHKBQ93100 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHKBQ93100 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHKBQ93100 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHKBQ93100 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHKBQ93100 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHKBQ93100 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHKBQ93100 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHKBQ93100 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHKBQ93100 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHKBQ93100 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHKBQ93100 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHKBQ93100 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHKBQ93100 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHKBQ93100 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHKBQ93100 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHKBQ93100 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHKBQ93100 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHKBQ93100 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHKBQ93100 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PHKBQ93100 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHKBQ93100 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHKBQ93100 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHKBQ93100 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHKBQ93100 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHKBQ93100 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHKBQ93100 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHKBQ93100 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHKBQ93100 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHKBQ93100 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHKBQ93100 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHKBQ93100 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHKBQ93100 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHKBQ93100 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHKBQ93100 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHKBQ93100 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHKBQ93100 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHKBQ93100 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHKBQ93100 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHKBQ93100 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHKBQ93100 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PHKBQ93100 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHKBQ93100 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHKBQ93100 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PHKBQ93100 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PHKBQ93100 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms