Protein–RNA interactions for Protein: Q92772

CDKL2, Cyclin-dependent kinase-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL2Q92772 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDKL2Q92772 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL2Q92772 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.6 ms