Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT25

CDC42BPA, Serine/threonine-protein kinase MRCK alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42BPAQ5VT25 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CDC42BPAQ5VT25 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CDC42BPAQ5VT25 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CDC42BPAQ5VT25 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CDC42BPAQ5VT25 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CDC42BPAQ5VT25 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CDC42BPAQ5VT25 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CDC42BPAQ5VT25 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CDC42BPAQ5VT25 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CDC42BPAQ5VT25 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CDC42BPAQ5VT25 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CDC42BPAQ5VT25 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CDC42BPAQ5VT25 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CDC42BPAQ5VT25 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CDC42BPAQ5VT25 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CDC42BPAQ5VT25 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CDC42BPAQ5VT25 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CDC42BPAQ5VT25 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CDC42BPAQ5VT25 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CDC42BPAQ5VT25 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CDC42BPAQ5VT25 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CDC42BPAQ5VT25 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CDC42BPAQ5VT25 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CDC42BPAQ5VT25 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
CDC42BPAQ5VT25 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CDC42BPAQ5VT25 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CDC42BPAQ5VT25 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CDC42BPAQ5VT25 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CDC42BPAQ5VT25 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CDC42BPAQ5VT25 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CDC42BPAQ5VT25 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CDC42BPAQ5VT25 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CDC42BPAQ5VT25 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CDC42BPAQ5VT25 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CDC42BPAQ5VT25 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CDC42BPAQ5VT25 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
CDC42BPAQ5VT25 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CDC42BPAQ5VT25 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CDC42BPAQ5VT25 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CDC42BPAQ5VT25 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CDC42BPAQ5VT25 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CDC42BPAQ5VT25 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CDC42BPAQ5VT25 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CDC42BPAQ5VT25 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CDC42BPAQ5VT25 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CDC42BPAQ5VT25 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CDC42BPAQ5VT25 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CDC42BPAQ5VT25 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CDC42BPAQ5VT25 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms