Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V9

Putative uncharacterized protein ENSP00000334305, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3C1V9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Q3C1V9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Q3C1V9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Q3C1V9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Q3C1V9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Q3C1V9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Q3C1V9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Q3C1V9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Q3C1V9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Q3C1V9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Q3C1V9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Q3C1V9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Q3C1V9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Q3C1V9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Q3C1V9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Q3C1V9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Q3C1V9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Q3C1V9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Q3C1V9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Q3C1V9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Q3C1V9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Q3C1V9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Q3C1V9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Q3C1V9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Q3C1V9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Q3C1V9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Q3C1V9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Q3C1V9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Q3C1V9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Q3C1V9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Q3C1V9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Q3C1V9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Q3C1V9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Q3C1V9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Q3C1V9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Q3C1V9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Q3C1V9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Q3C1V9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Q3C1V9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Q3C1V9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Q3C1V9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Q3C1V9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Q3C1V9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Q3C1V9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Q3C1V9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Q3C1V9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Q3C1V9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Q3C1V9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Q3C1V9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Q3C1V9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Q3C1V9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Q3C1V9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Q3C1V9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Q3C1V9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Q3C1V9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Q3C1V9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Q3C1V9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Q3C1V9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Q3C1V9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Q3C1V9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Q3C1V9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q3C1V9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q3C1V9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q3C1V9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q3C1V9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q3C1V9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q3C1V9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q3C1V9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q3C1V9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Q3C1V9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Q3C1V9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Q3C1V9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q3C1V9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Q3C1V9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q3C1V9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q3C1V9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q3C1V9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q3C1V9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q3C1V9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q3C1V9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q3C1V9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q3C1V9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q3C1V9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q3C1V9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q3C1V9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q3C1V9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q3C1V9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q3C1V9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q3C1V9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q3C1V9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q3C1V9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q3C1V9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q3C1V9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q3C1V9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q3C1V9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q3C1V9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Q3C1V9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Q3C1V9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Q3C1V9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Q3C1V9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms