Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTF1Q16619 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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CTF1Q16619 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTF1Q16619 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CTF1Q16619 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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