Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC33.79■■■■□ 3
PTPRKQ15262 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
PTPRKQ15262 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PTPRKQ15262 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
PTPRKQ15262 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PTPRKQ15262 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
PTPRKQ15262 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
PTPRKQ15262 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PTPRKQ15262 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PTPRKQ15262 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
PTPRKQ15262 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
PTPRKQ15262 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
PTPRKQ15262 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PTPRKQ15262 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
PTPRKQ15262 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC33.78■■■■□ 3
PTPRKQ15262 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
PTPRKQ15262 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
PTPRKQ15262 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
PTPRKQ15262 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
PTPRKQ15262 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PTPRKQ15262 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
PTPRKQ15262 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
PTPRKQ15262 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC33.77■■■■□ 3
PTPRKQ15262 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PTPRKQ15262 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC33.77■■■■□ 3
PTPRKQ15262 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PTPRKQ15262 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PTPRKQ15262 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PTPRKQ15262 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
PTPRKQ15262 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PTPRKQ15262 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PTPRKQ15262 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PTPRKQ15262 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PTPRKQ15262 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PTPRKQ15262 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PTPRKQ15262 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PTPRKQ15262 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PTPRKQ15262 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PTPRKQ15262 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PTPRKQ15262 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PTPRKQ15262 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PTPRKQ15262 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PTPRKQ15262 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PTPRKQ15262 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PTPRKQ15262 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PTPRKQ15262 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PTPRKQ15262 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PTPRKQ15262 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PTPRKQ15262 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PTPRKQ15262 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PTPRKQ15262 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PTPRKQ15262 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
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PTPRKQ15262 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTPRKQ15262 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTPRKQ15262 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTPRKQ15262 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTPRKQ15262 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTPRKQ15262 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTPRKQ15262 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTPRKQ15262 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
PTPRKQ15262 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
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PTPRKQ15262 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTPRKQ15262 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTPRKQ15262 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTPRKQ15262 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PTPRKQ15262 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PTPRKQ15262 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PTPRKQ15262 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PTPRKQ15262 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
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PTPRKQ15262 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PTPRKQ15262 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PTPRKQ15262 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PTPRKQ15262 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PTPRKQ15262 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PTPRKQ15262 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PTPRKQ15262 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
PTPRKQ15262 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PTPRKQ15262 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PTPRKQ15262 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PTPRKQ15262 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PTPRKQ15262 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
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