Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFIAQ12857 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
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