Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RPL6Q02878 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms